该剧讲述了五百年前的大明朝，京城一隅经营着一家天和医馆，馆主陈慕禅以专治疑难杂症而享誉京城，但是他却有一个不为人知的身份，那就是西厂的特务。某天，陈慕禅突然失踪，志愿成为御医的学徒朱一品得到一个关系重大的卷轴。家庭变故让大小姐陈安安伤心不已，而卷轴的出现则让一品、赵布祝、陈安安卷入了前所未有的风波中来。分别隶属东厂和西厂的两大高手杨宇轩和柳若馨相继潜入天和医馆，在钩心斗角、尔虞我诈的同时，也衍生出一段剪不断理还乱的儿女情长戏码。